Table 7 Gene Ontology classification of protein-coding genes by pathway

2-arachidonoylglycerol biosynthesis (P05726)

4

0.00 %

0.10 %

5-Hydroxytryptamine biosynthesis (P04371)

2

0.00 %

0.00 %

5-Hydroxytryptamine degradation (P04372)

3

0.00 %

0.10 %

5HT1 type receptor mediated signaling pathway (P04373)

25

0.20 %

0.60 %

5HT2 type receptor mediated signaling pathway (P04374)

39

0.30 %

1.00 %

5HT3 type receptor mediated signaling pathway (P04375)

12

0.10 %

0.30 %

5HT4 type receptor mediated signaling pathway (P04376)

16

0.10 %

0.40 %

Acetate utilization (P02722)

3

0.00 %

0.10 %

Activin-beta signaling pathway (P06210)

3

0.00 %

0.10 %

Adenine and hypoxanthine salvage pathway (P02723)

6

0.10 %

0.10 %

Adrenaline and noradrenaline biosynthesis (P00001)

22

0.20 %

0.50 %

Alanine biosynthesis (P02724)

2

0.00 %

0.00 %

ALP23B_signaling_pathway (P06209)

3

0.00 %

0.10 %

Alpha adrenergic receptor signaling pathway (P00002)

20

0.20 %

0.50 %

Alzheimer disease-amyloid secretase pathway (P00003)

50

0.40 %

1.20 %

Alzheimer disease-presenilin pathway (P00004)

74

0.60 %

1.80 %

Aminobutyrate degradation (P02726)

2

0.00 %

0.00 %

Androgen/estrogene/progesterone biosynthesis (P02727)

3

0.00 %

0.10 %

Angiogenesis (P00005)

125

1.10 %

3.10 %

Angiotensin II-stimulated signaling through G proteins and beta-arrestin (P05911)

30

0.30 %

0.70 %

Apoptosis signaling pathway (P00006)

80

0.70 %

2.00 %

Arginine biosynthesis (P02728)

4

0.00 %

0.10 %

Ascorbate degradation (P02729)

2

0.00 %

0.00 %

Asparagine and aspartate biosynthesis (P02730)

4

0.00 %

0.10 %

ATP synthesis (P02721)

6

0.10 %

0.10 %

Axon guidance mediated by netrin (P00009)

29

0.30 %

0.70 %

Axon guidance mediated by semaphorins (P00007)

18

0.20 %

0.40 %

Axon guidance mediated by Slit/Robo (P00008)

18

0.20 %

0.40 %

B cell activation (P00010)

49

0.40 %

1.20 %

Beta1 adrenergic receptor signaling pathway (P04377)

26

0.20 %

0.60 %

Beta2 adrenergic receptor signaling pathway (P04378)

26

0.20 %

0.60 %

Beta3 adrenergic receptor signaling pathway (P04379)

11

0.10 %

0.30 %

Blood coagulation (P00011)

22

0.20 %

0.50 %

BMP_signaling_pathway-drosophila (P06211)

2

0.00 %

0.00 %

Cadherin signaling pathway (P00012)

103

0.90 %

2.50 %

Carnitine and CoA metabolism (P02732)

1

0.00 %

0.00 %

Carnitine metabolism (P02733)

1

0.00 %

0.00 %

Cell cycle (P00013)

17

0.10 %

0.40 %

Cholesterol biosynthesis (P00014)

9

0.10 %

0.20 %

Circadian clock system (P00015)

9

0.10 %

0.20 %

Coenzyme A biosynthesis (P02736)

6

0.10 %

0.10 %

Cortocotropin releasing factor receptor signaling pathway (P04380)

27

0.20 %

0.70 %

Cysteine biosynthesis (P02737)

1

0.00 %

0.00 %

Cytoskeletal regulation by Rho GTPase (P00016)

57

0.50 %

1.40 %

De novo purine biosynthesis (P02738)

19

0.20 %

0.50 %

De novo pyrimidine deoxyribonucleotide biosynthesis (P02739)

6

0.10 %

0.10 %

De novo pyrmidine ribonucleotides biosythesis (P02740)

8

0.10 %

0.20 %

DNA replication (P00017)

19

0.20 %

0.50 %

Dopamine receptor mediated signaling pathway (P05912)

48

0.40 %

1.20 %

DPP_signaling_pathway (P06213)

2

0.00 %

0.00 %

DPP-SCW_signaling_pathway (P06212)

2

0.00 %

0.00 %

EGF receptor signaling pathway (P00018)

101

0.90 %

2.50 %

Endogenous_cannabinoid_signaling (P05730)

18

0.20 %

0.40 %

Endothelin signaling pathway (P00019)

65

0.60 %

1.60 %

Enkephalin release (P05913)

17

0.10 %

0.40 %

FAS signaling pathway (P00020)

24

0.20 %

0.60 %

FGF signaling pathway (P00021)

86

0.70 %

2.10 %

Flavin biosynthesis (P02741)

2

0.00 %

0.00 %

Folate biosynthesis (P02742)

2

0.00 %

0.00 %

Formyltetrahydroformate biosynthesis (P02743)

4

0.00 %

0.10 %

Fructose galactose metabolism (P02744)

9

0.10 %

0.20 %

GABA-B_receptor_II_signaling (P05731)

30

0.30 %

0.70 %

Gamma-aminobutyric acid synthesis (P04384)

5

0.00 %

0.10 %

GBB_signaling_pathway (P06214)

2

0.00 %

0.00 %

General transcription by RNA polymerase I (P00022)

13

0.10 %

0.30 %

General transcription regulation (P00023)

30

0.30 %

0.70 %

Glutamine glutamate conversion (P02745)

2

0.00 %

0.00 %

Glycolysis (P00024)

18

0.20 %

0.40 %

Gonadotropin releasing hormone receptor pathway (P06664)

185

1.60 %

4.60 %

Hedgehog signaling pathway (P00025)

19

0.20 %

0.50 %

Heme biosynthesis (P02746)

8

0.10 %

0.20 %

Heterotrimeric G-protein signaling pathway-Gi alpha and Gs alpha mediated pathway (P00026)

103

0.90 %

2.50 %

Heterotrimeric G-protein signaling pathway-Gq alpha and Go alpha mediated pathway (P00027)

86

0.70 %

2.10 %

Heterotrimeric G-protein signaling pathway-rod outer segment phototransduction (P00028)

17

0.10 %

0.40 %

Histamine H1 receptor mediated signaling pathway (P04385)

22

0.20 %

0.50 %

Histamine H2 receptor mediated signaling pathway (P04386)

9

0.10 %

0.20 %

Huntington disease (P00029)

112

1.00 %

2.80 %

Hypoxia response via HIF activation (P00030)

21

0.20 %

0.50 %

Inflammation mediated by chemokine and cytokine signaling pathway (P00031)

135

1.20 %

3.30 %

Insulin/IGF pathway-mitogen activated protein kinase kinase/MAP kinase cascade (P00032)

26

0.20 %

0.60 %

Insulin/IGF pathway-protein kinase B signaling cascade (P00033)

30

0.30 %

0.70 %

Integrin signalling pathway (P00034)

135

1.20 %

3.30 %

Interferon-gamma signaling pathway (P00035)

24

0.20 %

0.60 %

Interleukin signaling pathway (P00036)

59

0.50 %

1.50 %

Ionotropic glutamate receptor pathway (P00037)

41

0.40 %

1.00 %

Isoleucine biosynthesis (P02748)

3

0.00 %

0.10 %

JAK/STAT signaling pathway (P00038)

15

0.10 %

0.40 %

Leucine biosynthesis (P02749)

2

0.00 %

0.00 %

Lipoate_biosynthesis (P02750)

2

0.00 %

0.00 %

Mannose metabolism (P02752)

5

0.00 %

0.10 %

Metabotropic glutamate receptor group I pathway (P00041)

19

0.20 %

0.50 %

Metabotropic glutamate receptor group II pathway (P00040)

25

0.20 %

0.60 %

Metabotropic glutamate receptor group III pathway (P00039)

45

0.40 %

1.10 %

Methionine biosynthesis (P02753)

2

0.00 %

0.00 %

Methylcitrate cycle (P02754)

2

0.00 %

0.00 %

Methylmalonyl pathway (P02755)

3

0.00 %

0.10 %

mRNA splicing (P00058)

6

0.10 %

0.10 %

Muscarinic acetylcholine receptor 1 and 3 signaling pathway (P00042)

38

0.30 %

0.90 %

Muscarinic acetylcholine receptor 2 and 4 signaling pathway (P00043)

29

0.30 %

0.70 %

P53 pathway feedback loops 1 (P04392)

5

0.00 %

0.10 %

P53 pathway feedback loops 2 (P04398)

41

0.40 %

1.00 %

Parkinson disease (P00049)

74

0.60 %

1.80 %

PDGF signaling pathway (P00047)

105

0.90 %

2.60 %

Pentose phosphate pathway (P02762)

7

0.10 %

0.20 %

Phenylethylamine degradation (P02766)

1

0.00 %

0.00 %

PI3 kinase pathway (P00048)

40

0.30 %

1.00 %

Plasminogen activating cascade (P00050)

3

0.00 %

0.10 %

PLP biosynthesis (P02759)

1

0.00 %

0.00 %

Proline biosynthesis (P02768)

4

0.00 %

0.10 %

Purine metabolism (P02769)

7

0.10 %

0.20 %

Pyridoxal phosphate salvage pathway (P02770)

1

0.00 %

0.00 %

Pyrimidine Metabolism (P02771)

8

0.10 %

0.20 %

Pyruvate metabolism (P02772)

6

0.10 %

0.10 %

Ras Pathway (P04393)

61

0.50 %

1.50 %

S adenosyl methionine biosynthesis (P02773)

2

0.00 %

0.00 %

Salvage pyrimidine deoxyribonucleotides (P02774)

1

0.00 %

0.00 %

Salvage pyrimidine ribonucleotides (P02775)

6

0.10 %

0.10 %

SCW_signaling_pathway (P06216)

2

0.00 %

0.00 %

Serine glycine biosynthesis (P02776)

5

0.00 %

0.10 %

Succinate to proprionate conversion (P02777)

2

0.00 %

0.00 %

Sulfate assimilation (P02778)

2

0.00 %

0.00 %

Synaptic_vesicle_trafficking (P05734)

24

0.20 %

0.60 %

T cell activation (P00053)

58

0.50 %

1.40 %

TCA cycle (P00051)

9

0.10 %

0.20 %

TGF-beta signaling pathway (P00052)

62

0.50 %

1.50 %

Thiamine metabolism (P02780)

3

0.00 %

0.10 %

Threonine biosynthesis (P02781)

2

0.00 %

0.00 %

Thyrotropin-releasing hormone receptor signaling pathway (P04394)

35

0.30 %

0.90 %

Toll receptor signaling pathway (P00054)

39

0.30 %

1.00 %

Toll_pathway_drosophila (P06217)

1

0.00 %

0.00 %

Transcription regulation by bZIP transcription factor (P00055)

41

0.40 %

1.00 %

Triacylglycerol metabolism (P02782)

1

0.00 %

0.00 %

Tryptophan biosynthesis (P02783)

1

0.00 %

0.00 %

Tyrosine biosynthesis (P02784)

1

0.00 %

0.00 %

Ubiquitin proteasome pathway (P00060)

50

0.40 %

1.20 %

Valine biosynthesis (P02785)

3

0.00 %

0.10 %

Vasopressin synthesis (P04395)

11

0.10 %

0.30 %

VEGF signaling pathway (P00056)

47

0.40 %

1.20 %

Vitamin B6 metabolism (P02787)

3

0.00 %

0.10 %

Vitamin D metabolism and pathway (P04396)

7

0.10 %

0.20 %

Wnt signaling pathway (P00057)

211

1.80 %

5.20 %

Xanthine and guanine salvage pathway (P02788)

4

0.00 %

0.10 %